Aposentou-se da diretoria em 2001 e foi suspenso por um ano, retornando por duas temporadas ao Corinthians até que tem como fazer aposta da lotofacil pela internet ♠ nova diretoria decidiu dispensá-lo após seu caso com o Corinthians, alegando motivos que não envolviam o futebol profissional.

Retornou ao Palmeiras ♠ na reta final do Campeonato Paulista de 2001, onde foi titular, mas o Palmeiras acabou rebaixado logo depois.

Em junho de ♠ 2002, Nilson anunciou que se aposentaria depois de 4 anos e não estaria relacionado ao clube durante

o ano em que ♠ passou no Corinthians.

Em setembro de 2008, Nilson foi convocado para o elenco Sub-15 e foi titular de todas as partidas ♠ do Campeonato Paulista Sub-20 em 2010.